Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NUP160Q12769 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP160Q12769 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms