Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 POP6YGR030C 477 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 NIT3YLR351C 876 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 USV1YPL230W 1176 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 REC8YPR007C 2043 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 MIC60YKR016W 1623 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 SER3YER081W 1410 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 RPA135YPR010C 3612 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 RRP5YMR229C 5190 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 KTR6YPL053C 1341 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 OPI6YDL096C 327 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 CAB2YIL083C 1098 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ATP12YJL180C 978 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 DID4YKL002W 699 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 GOT1YMR292W 417 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YOR082CYOR082C 342 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 HUT1YPL244C 1020 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 MRPL51YPR100W 423 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 PKH1YDR490C 2301 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YPR148CYPR148C 1308 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ISW2YOR304W 3363 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 UTP25YIL091C 2166 nt3.17□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 PRM15YMR278W 1869 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 MGT1YDL200C 567 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 DDI2YFL061W 678 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ECO1YFR027W 846 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 DDI3YNL335W 678 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 HPA2YPR193C 471 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 DAP2YHR028C 2457 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 PFK26YIL107C 2484 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 TRM1YDR120C 1713 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 CEX1YOR112W 2286 nt3.16□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 CLN2YPL256C 1638 nt3.15□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 QRI7YDL104C 1224 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YDR149CYDR149C 708 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PAU10YDR542W 363 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PAU11YGL261C 363 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PAU13YHL046C 363 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 AGE2YIL044C 897 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PAU4YLR461W 363 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RAD33YML011C 534 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 MED11YMR112C 396 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RPC34YNR003C 954 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YOR263CYOR263C 408 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 DIB1YPR082C 432 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 LCB5YLR260W 2064 nt3.15□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PHO5YBR093C 1404 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PCL2YDL127W 927 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YAR075WYAR075W 474 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SPO20YMR017W 1194 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RRG9YNL213C 645 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 GIS2YNL255C 462 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PFK27YOL136C 1194 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 OXR1YPL196W 822 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 NIP7YPL211W 546 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 GRX1YCL035C 333 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 TRE2YOR256C 2430 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YMR317WYMR317W 3423 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 MET10YFR030W 3108 nt3.14□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 BCS1YDR375C 1371 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SET1YHR119W 3243 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YDR090CYDR090C 933 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PUG1YER185W 912 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 VAM10YOR068C 345 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RPS7AYOR096W 573 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RIB5YBR256C 717 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 GPI1YGR216C 1830 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YHR080CYHR080C 4038 nt3.13□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SDS23YGL056C 1584 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 FAS1YKL182W 6156 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 DSL1YNL258C 2265 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YCR015CYCR015C 954 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RPS29BYDL061C 171 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 TLG1YDR468C 675 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 TRI1YMR233W 681 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 MDJ2YNL328C 441 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YPR077CYPR077C 372 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CHA4YLR098C 1947 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SEC59YMR013C 1560 nt3.12□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CUE3YGL110C 1875 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 GLC3YEL011W 2115 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 MRS2YOR334W 1413 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SNT1YCR033W 3681 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SLM2YNL047C 1971 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 RRP8YDR083W 1179 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YDR290WYDR290W 330 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YDR355CYDR355C 303 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CDC26YFR036W 375 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YIR040CYIR040C 333 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 IRC18YJL037W 675 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YJR111CYJR111C 852 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 BUR2YLR226W 1188 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 COS1YNL336W 1146 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 SSE2YBR169C 2082 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 CHO2YGR157W 2610 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 YIG1YPL201C 1386 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 GCN1YGL195W 8019 nt3.11□□□□□ -1.91
RRP42Q12277 PDS1YDR113C 1122 nt3.1□□□□□ -1.91
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