Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNA1Q09470 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms