Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCBP1Q09161 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms