Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACSM1Q08AH1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACSM1Q08AH1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms