Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD47Q08722 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD47Q08722 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD47Q08722 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD47Q08722 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD47Q08722 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD47Q08722 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CD47Q08722 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms