Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TGM3Q08188 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGM3Q08188 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms