Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF4Q08170 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms