Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
ERCC6Q03468 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ERCC6Q03468 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms