Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDR2Q01850 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDR2Q01850 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms