Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD3P84022 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD3P84022 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms