Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTHL1P78549 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTHL1P78549 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms