Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRX1P78414 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRX1P78414 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRX1P78414 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRX1P78414 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRX1P78414 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRX1P78414 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRX1P78414 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRX1P78414 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRX1P78414 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms