Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN2AP68543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms