Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SUMO1P63165 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SUMO1P63165 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms