Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V0D1P61421 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V0D1P61421 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms