Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4A1P60842 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4A1P60842 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A1P60842 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A1P60842 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A1P60842 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4A1P60842 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms