Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVFRD-1P60508 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms