Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3EP60228 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3EP60228 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3EP60228 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms