Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP4BP1P59074 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms