Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CABP4P57796 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP4P57796 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP4P57796 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP4P57796 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CABP4P57796 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CABP4P57796 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CABP4P57796 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CABP4P57796 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CABP4P57796 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP4P57796 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP4P57796 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms