Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSDMDP57764 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSDMDP57764 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms