Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF3P57682 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF3P57682 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF3P57682 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF3P57682 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms