Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BACE1P56817 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BACE1P56817 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BACE1P56817 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BACE1P56817 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BACE1P56817 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BACE1P56817 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BACE1P56817 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BACE1P56817 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BACE1P56817 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms