Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCKAP1LP55160 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCKAP1LP55160 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms