Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AQP4P55087 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AQP4P55087 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AQP4P55087 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AQP4P55087 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AQP4P55087 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AQP4P55087 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AQP4P55087 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms