Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ATP12AP54707 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP12AP54707 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms