Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COPAP53621 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COPAP53621 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COPAP53621 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPAP53621 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPAP53621 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPAP53621 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COPAP53621 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COPAP53621 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COPAP53621 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COPAP53621 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms