Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABRB2P47870 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRB2P47870 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms