Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD4P46934 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4P46934 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms