Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNA4P43681 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA4P43681 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA4P43681 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms