Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms