Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTTP42858 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTTP42858 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTTP42858 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HTTP42858 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTTP42858 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTTP42858 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTTP42858 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTTP42858 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTTP42858 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTTP42858 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTTP42858 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms