Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms