Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF9P41273 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF9P41273 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms