Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PBX1P40424 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PBX1P40424 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX1P40424 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX1P40424 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX1P40424 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX1P40424 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX1P40424 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PBX1P40424 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX1P40424 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX1P40424 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PBX1P40424 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PBX1P40424 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PBX1P40424 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PBX1P40424 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PBX1P40424 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PBX1P40424 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms