Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 SAT4YCR008W 1812 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 UBX3YDL091C 1368 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 MSM1YGR171C 1728 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 AEP2YMR282C 1743 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 ERP1YAR002C-A 660 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 MRP21YBL090W 534 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 DCI1YOR180C 816 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 NHP6AYPR052C 282 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YBR090CYBR090C 369 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 RGT1YKL038W 3513 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 DAK1YML070W 1755 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 DOA1YKL213C 2148 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 HFA1YMR207C 6372 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 HRR25YPL204W 1485 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 PDC1YLR044C 1692 nt5.69□□□□□ -1.5
GEF1P37020 RET1YOR207C 3450 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 HXT14YNL318C 1623 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YPD1YDL235C 504 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 CWC21YDR482C 408 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YHR097CYHR097C 1101 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 SYS1YJL004C 612 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 APS1YLR170C 471 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 PET123YOR158W 957 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 RCN2YOR220W 798 nt5.68□□□□□ -1.5
GEF1P37020 HRK1YOR267C 2280 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 BSC1YDL037C 987 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 PEA2YER149C 1263 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YIP1YGR172C 747 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 ECM34YHL043W 513 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YJL220WYJL220W 453 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 RPN13YLR421C 471 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 TOA1YOR194C 861 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 WHI3YNL197C 1986 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 GDB1YPR184W 4611 nt5.67□□□□□ -1.5
GEF1P37020 ROK1YGL171W 1695 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 NRD1YNL251C 1728 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 RAT1YOR048C 3021 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YEL077CYEL077C 3834 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 MRPL39YML009C 213 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 FLC1YPL221W 2382 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 HES1YOR237W 1305 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YPR148CYPR148C 1308 nt5.66□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt5.65□□□□□ -1.5
GEF1P37020 MRF1YGL143C 1242 nt5.65□□□□□ -1.5
GEF1P37020 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt5.65□□□□□ -1.5
GEF1P37020 ADF1YCL058W-A 342 nt5.65□□□□□ -1.5
GEF1P37020 TAF12YDR145W 1620 nt5.65□□□□□ -1.51
GEF1P37020 GSY1YFR015C 2127 nt5.65□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YBR238CYBR238C 2196 nt5.65□□□□□ -1.51
GEF1P37020 SLU7YDR088C 1149 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YGL159WYGL159W 1113 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YGR290WYGR290W 444 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YMR087WYMR087W 855 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YMR144WYMR144W 1029 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 MAK3YPR051W 531 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YAP1802YGR241C 1707 nt5.64□□□□□ -1.51
GEF1P37020 CLB3YDL155W 1284 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 GPP2YER062C 753 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YER084WYER084W 387 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 TRX2YGR209C 315 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 EPT1YHR123W 1176 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YJR087WYJR087W 351 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 ATG10YLL042C 504 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 TSR4YOL022C 1227 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 OPT2YPR194C 2634 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 PRM1YNL279W 1986 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 RTT109YLL002W 1311 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 PFK1YGR240C 2964 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 BUD22YMR014W 1560 nt5.63□□□□□ -1.51
GEF1P37020 HMLALPHA2YCL067C 633 nt5.62□□□□□ -1.51
GEF1P37020 MATALPHA2YCR039C 633 nt5.62□□□□□ -1.51
GEF1P37020 BET4YJL031C 984 nt5.62□□□□□ -1.51
GEF1P37020 NNF1YJR112W 606 nt5.62□□□□□ -1.51
GEF1P37020 GPR1YDL035C 2886 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 ADP1YCR011C 3150 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 THO1YER063W 657 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YGR114CYGR114C 390 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YHI9YHR029C 885 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 CPS1YJL172W 1731 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YJR157WYJR157W 363 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 MDG1YNL173C 1101 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 MSE1YOL033W 1611 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 RSA1YPL193W 1146 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 CSM4YPL200W 471 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 snR24snR24 89 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 MNR2YKL064W 2910 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 PAH1YMR165C 2589 nt5.61□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YBP2YGL060W 1926 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YJL049WYJL049W 1353 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 NOP12YOL041C 1380 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 TRM82YDR165W 1335 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 EMP46YLR080W 1335 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YCR013CYCR013C 648 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 NOP6YDL213C 678 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 ECM11YDR446W 909 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 TFB3YDR460W 966 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 PMI40YER003C 1290 nt5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms