Protein–RNA interactions for Protein: P35998

PSMC2, 26S proteasome regulatory subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC2P35998 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC2P35998 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC2P35998 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC2P35998 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC2P35998 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMC2P35998 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMC2P35998 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMC2P35998 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMC2P35998 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms