Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN7P35236 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms