Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF2P35227 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF2P35227 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms