Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC129507.2-201ENST00000572499 748 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD11P31277 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms