Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD2P25440 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD2P25440 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD2P25440 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD2P25440 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD2P25440 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRD2P25440 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRD2P25440 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD2P25440 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD2P25440 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD2P25440 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD2P25440 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms