Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms