Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCP2P22307 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCP2P22307 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCP2P22307 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCP2P22307 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCP2P22307 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCP2P22307 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCP2P22307 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCP2P22307 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCP2P22307 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms