Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACO1P21399 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACO1P21399 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACO1P21399 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACO1P21399 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACO1P21399 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms