Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDSP20132 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDSP20132 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDSP20132 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDSP20132 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDSP20132 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDSP20132 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDSP20132 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDSP20132 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDSP20132 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDSP20132 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDSP20132 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDSP20132 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDSP20132 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDSP20132 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms