Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNNI3P19429 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms