Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELK1P19419 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ELK1P19419 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ELK1P19419 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELK1P19419 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELK1P19419 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELK1P19419 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ELK1P19419 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ELK1P19419 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ELK1P19419 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELK1P19419 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms