Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD58P19256 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD58P19256 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD58P19256 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD58P19256 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD58P19256 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD58P19256 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD58P19256 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD58P19256 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms