Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGB6P18564 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGB6P18564 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGB6P18564 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGB6P18564 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGB6P18564 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms